生命诞生于海洋，千姿百态的植物从水生到陆生，现在又有一部分回到水中，从而形成了像眼子菜这样特殊的类群。丰富的水环境使水生植物不用担心缺水的问题，但水过多也会产生呼吸不畅等后果。

　　水生植物要想呼吸，体内必须有发达的通气系统，以保证身体各部对氧气的需要。在水生植物新的或是旧的根内部，通常都会有纵向的细胞空隙，称为通气组织，通气组织可在根、匍匐根、茎或是叶柄中都可出现。通气组织可分为二种：一种藉由分开皮层或是周皮间的细胞，来增加空隙；另一种藉由溶解部分的细胞而形成的通气组织。各种植物的通气组织不尽相同，有其特定的分类方式。

　　一般说来。通气组织被认为可帮助植物茎的生长，使植物在低氧的情况下生存下来。如降低氧等其它气体运送到植物的阻力；增加氧气的储存空间。在低氧的土壤中，有毒物质会被氧化，变成没有活性的物质。许多生长在排水良好的水生植物，含有空间较大的通气组织。但一些具有淹水忍耐力的植物，如玉米、小麦、大麦等，生长在容易暴露在空气中的土壤，通气组织并不大；但若是生长再低氧的情况下时。通气组织很快的就会形成。

　　但是时间长了，水生植物的通气组织也会被水充满，所以水生植物的排水器也是重要的器官，它既能把通气组织中多余的水分排出体外，又可以从水中吸收矿物质等有用的物质。眼子菜的排水器由管胞直接与外界联系。

　　此外水生植物的叶片常呈带状、丝状或极薄，有利于增加采光面积和对CO2与无机盐的吸收；植物体具有较强的弹性和抗扭曲能力以适应水的流动。淡水植物具有自动调节渗透压的能力，而海水植物则是等渗的。