一些研究人员和临床医学工作者认为，阿斯伯格综合症可能是与孤独症相交叉的一种病症。其证据是，根据研究员和临床工作者的研究，在一些家庭中有的家庭成员患有阿斯伯格综合症，而其它家庭成员却患有孤独症。这种孤独症和阿斯伯格综合症在一个家庭的同现表明，至少在这些家庭中，一种共同的遗传原因导致了这两种症状。

　　但是其他研究者却认为，导致阿斯伯格综合症的遗传因素与导致孤独症的遗传因素是不同的，但是这两种发育障碍症都有一个共同的基因构成。来自芬兰的科学家正在努力解决这个问题，他们收集了芬兰17个家庭的DNA，这些家庭都只有阿斯伯格综合症这一种家族病史，除此之外没有任何其它发育障碍症病史。研究人员得到了第一个阿斯伯格综合症的遗传屏(genomic screen)。

　　据研究人员表示，这个遗传屏将有助于确定那些可能含有导致阿斯伯格综合症的基因的染色体的位置。研究者收集了62位Asperger 综合症患者的DNA和4位还没有被确诊但具有这种病症特征的患者的DNA，并对此进行比较，他们确定，有9个染色体区域可能含有和阿斯伯格综合症有关的基因，这些染色体区域分别位于染色体1，3，4，6，13和18上。研究人员说，基于统计学上的分析，最可能的区域是在染色体1，3和13上。其中两个染色体区域(在染色体3和18上)与过去对孤独症的遗传屏分析得到的数据是重合的。与阿斯伯格 综合症和孤独症有关的基因目前还没得到任何确定。

　　这项研究的有利条件是被研究的个体都来自芬兰，因此，他们都有一个相似的种族背景，这种在人口上的种族同一性可以帮助研究人员更容易找到遗传方面的影响。而不利条件就是无法确定这些研究结果是否适用其他种群。