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计算机程序再现百万年前动物基因组

  新浪科技 2004-12-04
科技时代_计算机程序再现百万年前哺乳动物基因组(图)
人类得到恐龙的基因组序列可能为时不晚

  美国科学家表示,已经开发出一种计算机程序,可以精确地绘制出生活在数百万年前的动物基因组。

  目前,科学家还不能在现有环境中完全一致地复制5万年前动物的基因。为了研究古代基因序列,科学家必须借助计算机程序来根据现在动物推测古代生物的基因组情况。但是,这种方法过去很受限制,因为一是对于现代基因组我们还没有确切的、充分的研究成果。 二是,计算机程序使用的运算法则也比较简单,只能识别单一的基因突变形式。

  现存哺乳动物物种,比如人类和老鼠,已经测出了各自不同的基因序列。其他的,比如鸡和非洲黑猩猩正在排序之中。科学家现在已经有了充足的序列资料来研究这些动物。并且数学运算法则也得到充分发展,已经能够考虑多种的基因突变类型。

  加利福尼亚大学的戴维-豪斯和他的同事们认为,对“计算机模拟基因”的实验时机已经成熟。为了验证他们的方法,先假定了一段古代哺乳动物的基因,然后用计算机模拟进化过程,并给出这些动物后代的基因序列。然后利用计算法则对后代基因进行逆推,看看能否重新创造出最初的祖先。他们逆推得到的结果正确率达到了98%。他们的研究报告发表在本周的《基因研究》杂志上。

  一旦科学家们认为这种技术是准确的,他们会将此计算法则用于研究真正哺乳动物的基因序列。

  研究小组对19个现存的哺乳动物,包括猪,人和老鼠,利用这种运算法则来推测它们共同祖先的基因,得到的动物看起来很彪悍,大约生活在7千多万年前。

  另一个惊讶的发现是,与祖先的基因序列相比,人类基因序列仅仅失去了11%叫做“碱基”的基因单位,而啮齿类动物大概达到39%。科学家想这可能是由于老鼠及其类似动物繁殖非常快,因此它们可能突变发生得更快,碱基丢失也多。

  用计算机重建祖先基因进行比较研究可能会给其他科学家提供一些线索,推测动物是什么时候、如何开始发生基因分化的,最终产生不同的物种。

  研究小组希望把研究对象扩大到其他的哺乳动物,最终的目标是搞清楚人类基因中每一个碱基的发展细节。

 


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