| 模拟生化反应 |
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| 杨秀 jskx 2002-03-06 |
创建一个计算机模拟的细胞是一个很复杂的过程，这种模拟不仅要考虑到组成细胞的所有分子及其参与的化学反应，还要考虑到调控细胞分子活动的各种方法。
模拟生化反应的最早尝试在计算机出现之后不久就开始了。20世纪80年代早期，美国威斯康星大学的卡尔?佛来登等人开发了KINSIM程序，这是一个重大的突破。KINSIM对模拟生化反应非常有效，以至于它的后续版本一直被广泛使用着。
我们来看一个计算机模拟病毒感染的例子。在病毒感染过程中，病毒进入宿主细胞，其基因开始生产病毒蛋白质。这些病毒的蛋白质霸占了宿主细胞．将其转变成一个病毒加工厂。最近，美国生物学家德鲁?安迪领导的小组用计算机模拟了一个称为T7的病毒。现在人们已经充分了解了它的机理，它只感染细菌的细胞，这使其成为计算机模拟的理想对象。该小组模拟出了24个病毒基因。最终，研究人员可以模拟出产生数百个新病毒所需的时间。这项工作的目的是要对抗病毒方法进行评价。科学家们一直企图减缓病毒的感染，目前的办法是阻断病毒基因的复制。病毒的哪一个基因的复制过程最适合被阻断呢?安迪的小组用模拟的T7病毒来测试不同的方案。他们分别阻断每一个基因的复制过程，然后模拟需要多长时间才能产生出新病毒。他们发现，与预想的相反，阻断某些基因的复制反而加速了T7病毒感染。通过计算机模拟．他们找到最有效破坏T7病毒的手段，就是阻止病毒保护性蛋白质膜编码基因的复制。
尽管模拟生化反应的研究已经取得一些重要的成就，但它们都是高度简化的细胞虚拟过程，这离模拟整个细胞还差得远呢。
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