与以往“神舟”系列发射时间不同，中国载人航天首次飞行选择在白天发射。载人航天工程发射场系统总设计师周建平说，“神舟”五号载人飞船选择在白天发射，主要是考虑白天温度有利于发射人员工作，而且万一发生意外可充分保障航天员的安全。
周建平说，按照中国载人航天首次飞行计划，航天员将乘坐飞船在太空绕地球飞行１４圈，时间大约２１小时。选择白天发射能够保证飞船返回地面时同样是白天，有利于地面搜救人员找寻目标。
航天发射需要确定一天中的某一个时间段作为飞船发射的时机，这个时间段被称为发射“窗口”。周建平说，一号至四号“神舟”飞船的发射“窗口”选择在夜晚，主要是便于飞船发射升空时，地面的光学跟踪测量仪易于捕捉到目标。而这次发射与以往最大的不同，是首次载人飞行。因此，以人为本，充分保障航天员的安全，就成了这次发射最大的特点
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