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专门处理“生物信息”的高性能计算机


新华网 2005-10-09
    我国有了专门处理生物信息的高性能计算机!中科院北京基因组研究所和计算技术研究所的科学家不久前研制成功了生物信息处理专用计算机――曙光4000H,计算机通用部分峰值浮点运算速度达到每秒5040亿次。这一项目日前在京通过中科院组织的专家验收。

    针对基因学算法数据量大、并行度高、运算类型单一、重复性较强等生物信息学的计算特点,科学家历经两年多的攻关,设计开发了“曙光4000H”这一面向生物信息处理的应用专用计算机,包括了90个通用处理器,10块生物专用硬件加速卡,专用计算机的内存总容量为137GB。

    通过开发专用计算机及其算法,项目组已申请并被受理国家发明专利3项,获得授权国家发明专利1项,取得软件登记证书4项,发表SCI、EI收录学术论文32篇。这一计算机业已成功应用于水稻基因组精细图、家蚕框架图等大型基因组的组装工作。

    验收专家组认为,项目组培养了一支熟悉生物信息算法分析和软件设计、计算机专用加速硬件技术的跨专业研究开发队伍,研制了生物信息专用计算机,设计开发了一批新的算法和软件,形成了一批具有自主知识产权的核心技术和原型产品。

 
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